巨噬細(xì)胞（macrophage）是廣泛分布于幾乎全身各組織器官，主要定位于病原體易入侵的首道防線區(qū)域：如皮膚、黏膜及免疫反應(yīng)或者代謝活躍組織器官：如肝、脾、肺。常常它們分為定居/駐留型巨噬細(xì)胞（如肝臟庫普弗細(xì)胞、腦小膠質(zhì)細(xì)胞，皮膚朗格漢斯細(xì)胞）和招募/遷移型巨噬細(xì)胞：由單核細(xì)胞分化而來。

定居/駐留型巨噬細(xì)胞在不同組織器官中的巨噬細(xì)胞具有獨特名稱和功能。他們多數(shù)在胚胎期形成，可自我更新，不依賴血液單核細(xì)胞補充。招募/遷移型巨噬細(xì)胞來源于血液中的單核細(xì)胞，在炎癥或組織損傷時遷移至病變部位，分化為巨噬細(xì)胞并參與免疫反應(yīng)。分布于血液、淋巴系統(tǒng)及炎癥組織中，具有較強遷移能力。

定居/駐留型巨噬細(xì)胞大多起源于胚胎卵黃囊，是長壽細(xì)胞，依賴自我更新。在實驗性穩(wěn)態(tài)條件下，研究表明成年小鼠的定居/駐留型巨噬細(xì)胞在大多數(shù)組織中能夠在當(dāng)?shù)刈晕腋拢要毩⒂贐MDMs。定居/駐留型巨噬細(xì)胞的發(fā)展、增殖和生存受到來自基質(zhì)細(xì)胞的三個主要因子（CSF1、IL-34和CSF2）的局部和全身控制，這些因子通過兩個巨噬細(xì)胞受體（CSF1R和CSF2R）發(fā)揮作用。CSF1在許多組織中有三種同型體形式。IL-34主要由神經(jīng)元和角質(zhì)形成細(xì)胞產(chǎn)生。肺上皮細(xì)胞產(chǎn)生的CSF2是肺泡巨噬細(xì)胞（AM）生存所必需的。招募/遷移型巨噬細(xì)胞的壽命較短。在實驗性應(yīng)激條件下，炎癥過程導(dǎo)致大量的炎癥性單核細(xì)胞進(jìn)入組織，但這并不意味著招募/遷移型巨噬細(xì)胞能自動替代定居/駐留型巨噬細(xì)胞。在一些實驗?zāi)Ｐ椭校M管BMDMs取代了定居/駐留型，但通過本地增殖的定居/駐留型巨噬細(xì)胞也已被觀察到恢復(fù)。移植研究顯示，供體的定居/駐留型巨噬細(xì)胞可以在其所在的器官中長時間存活。

巨噬細(xì)胞高度異質(zhì)。無論形態(tài)還是功能。分群，亞群，分型，亞型和功能分類，部位相關(guān)等都需要借助巨噬細(xì)胞表面的Marker，位置和功能來界定。因此，有客觀，也有主觀等因素來定義。巨噬細(xì)胞本身表達(dá)一系列能感應(yīng)生理參數(shù)的受體，如pH（見Cell文獻(xiàn)）、溫度、滲透壓、缺氧和壓力（見PANS文獻(xiàn)），也感應(yīng)多種代謝物和與凋亡、受損細(xì)胞相關(guān)的信號以及病原體相關(guān)分子模式。定居/駐留型巨噬細(xì)胞協(xié)助組織重塑，維持組織免疫微環(huán)境穩(wěn)態(tài)，有助于維護(hù)組織器官的特殊功能。如小鼠腹腔大型腹膜巨噬細(xì)胞有助于保護(hù)腹膜腔，并支持B細(xì)胞的功能，而小鼠腹腔小型腹膜巨噬細(xì)胞則源于骨髓并具有促炎癥性。Kupffer細(xì)胞在肝臟中清除衰老或受損的紅血細(xì)胞，并在鐵代謝中發(fā)揮重要作用。肺泡巨噬細(xì)胞位于肺泡的上皮表面，并通過吞噬細(xì)菌和顆粒物以及清除和降解肺表面活性劑來維持氣道的完整性。腎常駐巨噬細(xì)胞位于圍小管毛細(xì)血管的非腔側(cè)，持續(xù)監(jiān)測內(nèi)皮運輸并清除進(jìn)入腎間質(zhì)的免疫復(fù)合物和顆粒。